|
|
|
| Project title: | Development of method for identifying and isolating viable, non-labelled cells by telomere length |
|---|---|
| Project short title: | - |
| Number of project implementation agreement: | 1.1.1.2/VIAA/3/19/450 |
| Registration number: | 4239 |
| Department: | Biochip Scientific Laboratory |
| Administrating department: | Doctoral Studies Unit |
| Finance fund: | ERAF, 1.1.1.2. “Pēcdoktorantūras pētniecības atbalsts” |
| Project RTU role: | The sole implementer of the project |
| Status: | Ended |
| Project start date: | 01.03.2020. |
| Project end date: | 28.02.2023. |
| Title of grant issuer: | Valsts izglītības attīstības aģentūra |
| General manager: | Jurijs Dehtjars |
| Administrative manager: | Arita Stinka |
| Total finance: | |
| 133,805.88 EUR t. sk. ERAF finansējums 113,734.99 EUR (85%), valsts budžeta finansējums 13,380.58 EUR (10%) un Rīgas Tehniskās universitātes finansējums 6,690.31 EUR (5%). | |
| Summary: | |
|
Pēcdoktorants/projekta īstenotājs: Uldis Bērziņš |
|
| Activities: | |
|
Realizējamās aktivitātes: • Pirms mērīšana DEP-biočips tiks kalibrēts ar DEP-vidi un DEP-lodītēm; • Pirms mērīšanas AdMSC tiks mazgātas DEP-vidē divas reizes un sekojoši mērītas; • Tiks noteikti parametri, pie kuriem DEP ir 0 (Crossover frequencies), noteikts Clausius-Mossotti factor (Re[fcm]); • Ar DEP tiks atdalītas mirušas šūnas, optimizācijas ceļā; • Ar DEP metodi tiks noteikti dielektriskie parametri: 1. Radius (r, μm), 2. Membrane thickness (d, nm), 3. Medium conductivity (σm, S/m), 4. Medium permittivity (Ɛm, F/m), 5. Membrane conductivity (σmem, S/m), 6. Membrane permittivity (Ɛmem, F/m), 7. Cytoplasm conductivity (σint, S/m), 8. Cytoplasm permittivity, optimizācijas ceļā; • AdMSC tiks sortētas četrās grupās: 1. grupa – mazas šūnas ar relatīvi mazu virsmas laukumu, 2. grupa – mazas šūnas ar relatīvi lielu virsmas laukumu, 3. grupa – lielas šūnas ar relatīvi mazu virsmas laukumu, 4. grupa – lielas šūnas ar relatīvi lielu virsmas laukumu (katrā grupā ne mazāk kā 100 šūnu). Grupu “ieslēgšanas” kritēriji vērtējot mazas un lielas šūnas – jānosaka relatīvais šūnu izmērs, kurš skaidri diskriminē subpopulācijas, šūnu laukuma diskriminācijai starp subpopulācijām jābūt skaidri nodalāmai. Pārējās šūnas tiek izslēgtas no turpmākiem pētījumiem. • AdMSC gupu relatīvā telomēru garuma noteikšana ar komerciālu kitu (Telomere PNA Kit/FITC for Flow Cytometry (Dako, Denmark) plūsmas citometrā (tekstā, FACS) saskaņā ar ražotāja protokolu. • AdMSC grupu FACS mērījumu rezultātus salīdzinās ar sākotnējās heterogēnās AdMSC populācijas FACS mērījumu rezultātiem, tādējādi īstenojot šī darba plānoto pirmo rezultātu (cilmes šūnu atlasē ar optimizētu dielektroforēzes metodi ar garām telomērām šūnu skaita pieauguma efektivitāte par 40%, no taukaudiem izdalītu mezenhimālo cilmes šūnu, ar garām telomērām skaita pieaugums, pēc optimizētas dielektroforēzes metodes sortēšanas – virs 95% (no sākotējās koncentrācijas, pēc telomēru garuma, no 50% uz 95%). |
|
| Project published on RTU website: | 01.03.2020. |